Ricerca su metodologie computazionali di informatica nel settore biomedico

Abstract

Nel corso degli ultimi anni c’è stato un esplosivo aumento nella capacità di acquisizione dei dati sperimentali associato ad un parallelo abbassamento esponenziale nel costo. Grazie a queste precondizioni tecnologiche ed economiche, è ora possibile considerare progetti di ricerca biomedica che, all’interno di necessari vincoli di privacy e bioetica, si pongano alla confluenza di questi due flussi di dati e che abbiano come obiettivo studi ad alta risoluzione su coorti dell’ordine della decina di migliaia di individui. Studi cioè che, a tecnologia corrente, possono produrre ciascuno dataset dell'ordine della decina di petabyte, ed in cui la quantità di informazione da analizzare e gestire è destinata a crescere di un ordine di grandezza almeno ad ogni successiva (in tecnologia) campagna di acquisizione sperimentale sugli stessi campioni biologici. Lo scopo di COBIK è di costruire una piattaforma software, una biobanca computazionale, in grado di gestire in maniera uniforme ed efficiente tutto il flusso informatico/computazionale necessario a condurre studi a grande scala basati sull’integrazione sistematica di dati clinici e sperimentali, in particolare nel contesto della genomica.

The COBIK project deals with problems stemming from the recent huge increase in dataset size from biosciences and health informatics. Its main goal is building a software framework capable of efficiently and uniformly handling the computational throughput associated to large-scale studies based on the integration of clinical and experimental data, specifically in the field of genomics.